Program magazynowy Magfak może być zainstalowany na dowolnym dysku w systemie - standardowo przyjęto dysk C. Katalogu instalacyjnego (Magfak) nie należy zmieniać, ponieważ będą kłopoty z wykonywaniem kopii systemu. Aby przejść dalej wciśnij przycisk Next. Po podaniu przez program instalacyjny dysku i katalogu instalacyjnego C:\Magfak można przyciskiem Browse otworzyć okienko umożliwiające zmianę dysku. Wciśnięcie ponowne klawisza Next oznacza zgodę na podany dysk i system. Program instalacyjny po odczytaniu pierwszej dyskietki otworzy nowe okno (Setup Needs The Next Disk) prosząc o włożenie następnej dyskietki. Należy więc, po wyjęciu pierwszej, włożyć do stacji drugą dyskietkę i wcisnąć klawisz Ok. Jeżeli program jest na trzech dyskietkach to po pojawieniu się powyższego komunikatu wyjmujemy drugą dyskietkę, wkładamy trzecią i wciskamy klawisz Ok. Użycie przycisku Cancel podczas instalacji programu oznacza rezygnację z instalacji.